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2012 년 7 월 24 일

National Institute of Genetics Supercomputer System 구축

새로운 DNA 시퀀서의 빅 ddj 토토사이트 분석 가속

토토 사이트. (Hitachi라고 불리는 Nakanishi Hiroaki / Hightinafter)는 국제 DNA ddj 토토사이트베이스 건설을위한 슈퍼 컴퓨터 시스템, 국립 유전학 연구소 (Director : Ohara Yuji / Hightinafter) (대학 공동 사용 기관)를 구축했습니다.
  Genetics는이 시스템을 사용하여 미국과 유럽의 연구 기관과 협력하여 국제 뉴클레오티드 서열 ddj 토토사이트베이스를 구축하고 전 세계 연구원들에게 공개하기 위해 새로운 DNA 시퀀서를 가지고 있습니다.*1의 출력 정보와 같은 빅 ddj 토토사이트 분석을 가속화하기위한 IT 리소스를 제공합니다. 이를 통해 유전학 연구소는 전 세계의 연구원들이 라이프 스타일 관련 질병 및 암의 원인을 명확히하여 다양한 질병의 예방, 진단 및 치료에 기여하는 의학적 연구뿐만 아니라 생활 유기체 및 분자 생물학의 유전학과 관련된 기본 및 응용 연구에 기여하는 의학적 연구의 발달을 지원할 것입니다.

  Genetics Research Institute는 NCBI (National Center for Bioengineering and Information)가 운영하는 GenBank와 긴밀한 협력하여 국제 기본 서열 ddj ddj 토토사이트베이스를 구축했으며 EBI (European for Bioinformatics)가 운영하는 EMBL-BANK. 국제 핵 서열 ddj ddj 토토사이트베이스는 목적이나 국적에 관계없이보고 재사용 할 수있는 세계 과학의 공유 속성이며, 전 세계의 연구원들은 NCBI, EBI 및 Institute of Genetics의 세 가지 기관을 통해 국제 핵 서열 ddj ddj 토토사이트베이스에 연구 ddj ddj 토토사이트를 등록 할 수 있습니다. 이 국제 기본 서열 ddj ddj 토토사이트베이스가 처리하는 ddj ddj 토토사이트의 양은 최근 몇 년 동안 극적으로 증가하고 있습니다. 이러한 ddj ddj 토토사이트 부피의 증가의 이유는 최근에 새로운 DNA 시퀀서가 게놈 연구 분야에서 크게 개발 되었기 때문에, 인간 게놈을 포함한 다양한 유기체에 대한 게놈 정보에 대한 포괄적 인 분석이 가속화되고 있기 때문이다. 최신 새로운 DNA 시퀀서는 단편화 된 서열 ddj ddj 토토사이트로 알려진 단편화 DNA 서열을 분석 단위로 한 번의 측정으로 분열하는 DNA 서열에 의해 얻은 약 60 억 (약 1.8TB)의 ddj ddj 토토사이트를 생성한다. 이 새로운 유형의 DNA 시퀀서의 출현으로 전 세계 연구 기관에서 생성 된 단편 서열 ddj ddj 토토사이트의 양이 크게 증가했으며 기본 서열은 2010 년에 생성되었습니다.*2조각 ddj 토토사이트 PB (Petabytes)의 양입니다*3이것은 단위입니다. 또한, 우리는 3 세대 및 4 세대 DNA 시퀀서의 발전을 볼 것으로 예상되며, 미래에는 ddj 토토사이트 볼륨이 계속 증가 할 것입니다.
  이러한 이유로, 슈퍼 컴퓨터 시스템을 개선 할 때, Genetics는 DNA 분석 계산 속도와 같은 시스템 환경을 원했고, 매번 발생하는 빅 ddj 토토사이트를 빠르게 분석 할 수있는 ddj 토토사이트 저장소는 빅 ddj 토토사이트를 신속하게 처리 할 수있었습니다. 그들은 또한 전력 소비를 줄이고 싶었습니다.

  토토사이트 는 게놈 분야에서 슈퍼 컴퓨터 시스템의 구성을 포함하여 다양한 생명 과학 관련 시스템의 구성 및 운영을 통해 재배 한 노하우를 활용했으며, DNA 시퀀서에서 생성 된 빅 ddj 토토사이트를 분석 할 수 있었을뿐만 아니라 더 많은 에너지 절약 및 효율적인 유전체 분석을 달성하는 슈퍼 컴퓨터 시스템을 구축했습니다.
2014 년에 Genetics Research는 이번에 도입 된 시스템보다 시스템을 규모로 늘릴 계획입니다.

용어집

*1
새로운 DNA 시퀀서 : 화학적으로 가공 된 DNA 샘플에서 다양한 분석 과정을 수행함으로써 DNA의 기본 서열을 자동으로 읽는 장치.
*2
염기 시퀀스 : 핵산을 구성하는베이스 부분의 시퀀스
*3
PB (Petabels) : 약 1,000 조 바이트

슈퍼 컴퓨터 시스템 기능

1. 파일 시스템을 사용한 빅 ddj 토토사이트의 빠른 처리

 이 시간 소개 된 SuperComputer 시스템은 초고속 액세스를 허용하는 파일 시스템을 구현하며, 이는 새로운 DNA 시퀀서의 출현으로 생성 된 빅 ddj 토토사이트의 고속 처리를 달성하는 데 필요합니다.
  특정 기능은 여러 볼륨에 하나의 ddj 토토사이트를 배포하여 병렬 액세스를 허용하는 것입니다. 이를 통해 분석 서버가 ​​여러 파일 서버에 동시에 액세스하여 분석 처리를 수행하고 병렬로 분석 된 여러 ddj 토토사이트를 저장하여 처리 시간이 짧아집니다. 또한 파일 시스템과 분석 서버를 연결하는 네트워크 장치의 총 이론적 전송 대역폭은 960Gbps이며 계산을 수행 할 때 장치 간의 ddj 토토사이트 전송으로 인한 병목 현상은 피합니다.

2. 에어컨 환경에 대한 고효율 에어컨 및 컨설팅으로 PUE1.2를 실현하여 효율적인 전력 소비를 달성

  이번에는 생산에서 작동하는 슈퍼 컴퓨터 시스템은 세계적 수준의 에너지 절약 성능을 갖춘 랙 형 에어컨을 사용합니다. 팬에 의해 IT 랙의 뒷면으로 배출되는 서버에서 생성 된 열은 옆에 위치한 랙 형 에어컨에 의해 강화되며 전면으로 차가운 공기로 배출됩니다. 이 로컬 냉각 방법은 전형적인 벽 장착 에어컨의 언더 플로어 에어컨 방법보다 열 풀이 발생할 가능성이 적어 에어컨 마진을 줄일 수 있습니다. 또한 서버 룸 내에서 에어컨 환경에 대한 컨설팅을 제공하는 "Airissist"서비스를 활용함으로써 Hitachi가 개발 한 3D 열 유체 시뮬레이터를 사용하여 컴퓨터 및 에어컨 장비에 대한 최적의 레이아웃을 설계했습니다.*4in 5655_5706 |, 이전 모델은 1.9이지만 새로운 시스템은 현재 약 1.2이므로 효율적인 전력 소비를 달성합니다.

*4
PUE : IT 장비를 포함한 전체 ddj 토토사이트 센터 및 서버 룸의 전력 소비는 IT 장비의 전력 소비로 나눈 값입니다.
가장 효율적인 것은 Pue가 1.0입니다. IT 장비를 포함한 전체 ddj 토토사이트 센터 및 서버 룸의 전력 소비는 IT 장비의 전력 소비와 동일하며 ddj 토토사이트 센터 및 서버 룸에 공급되는 전체 전원은 IT 장비에 의해 소비되므로 폐기물이 없습니다.

[이미지] 랙 유형 에어컨의 모델 다이어그램

"슈퍼 컴퓨터 시스템"요약

[이미지] 슈퍼 컴퓨터 시스템 개요

관련 정보

이 문제에 대한 문의

토토 사이트. 정보 및 커뮤니케이션 시스템 공공 시스템 영업 부서
고객 관계 센터 [책임 : Sasaki Nishimoto]
Shinsuna Plaza, 1-6-27, Shinsuna, Koto-Ku, 도쿄 136-8632

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